La variante Omicron s’est propagée à travers la planète plus rapidement que n’importe quelle version précédente du Sars-CoV-2. Inauguré début novembre au Botswana, il a inondé la France au milieu d’une vague de pollution venue du Delta. Et il est vite devenu hégémonique : depuis février, il est identifié dans 100 % des virus séquencés dans l’affaire Covid-19, selon les données de santé publique en France.
Près de six mois après sa découverte, qu’avons-nous appris sur cette option, qui a contaminé des millions de Français ? Pour répondre à cette question, franceinfo a interrogé plusieurs experts.
Option avec un haut degré de transmission …
La rapidité avec laquelle Omicron a remplacé Delta est révélatrice de l’un des principaux avantages concurrentiels de cette option par rapport à ses prédécesseurs : son débit supérieur. Au 22 novembre 2021, Omicron n’était détecté que dans 0,1% des tests réalisés en France. Au 27 décembre 2021, il est présent dans plus de 66% des tests séquencés. Il était devenu majoritaire en un mois seulement. Un mois plus tard, le 24 janvier, il était dans près de 99% des tests séquencés.
L’arrivée d’Omicron a coïncidé avec l’accélération soudaine de la cinquième épidémie. D’environ 50 000 recensés mi-décembre 2021, le nombre de cas comptabilisés chaque jour a bondi à 365 000 le 24 janvier, avant de s’établir à environ 90 000 aujourd’hui.
Évolution du nombre de nouveaux cas de Covid-19 recensés chaque jour en France au 21 avril 2022 (FRANCEINFO)
Une partie de l’explication réside dans la structure d’Omicron elle-même, qui diffère considérablement de la souche Sars-CoV-2 originale identifiée à Wuhan (Chine). “Ce variant comporte une cinquantaine de mutations par rapport au virus d’origine, dont plus d’une trentaine dans la seule protéine Spike”, qui sert de clé à l’entrée du virus dans l’organisme, explique Sandrine Sarrazin, chercheuse à l’Inserm au centre Marseille-Luminy. pour l’immunologie. .
Cette différence structurelle avec la souche originale Sars-CoV-2 a deux conséquences. “Les mutations qui affectent la protéine Spike la rendent plus active lorsqu’elle pénètre son récepteur” et facilitent donc l’entrée du virus dans l’organisme, précise Mathieu Mahevas, immunologiste à l’hôpital Henri-Mondor de Créteil et à l’institut. Necker Enfants malades à Paris. “Cela peut expliquer pourquoi la période d’incubation semble plus courte avec Omicron que dans les versions précédentes : vous devenez généralement contagieux plus tôt et probablement en moins de temps.”
La deuxième conséquence de ces nombreuses mutations concerne la capacité de ce variant à contrecarrer les défenses créées par notre système immunitaire. Les vaccins Covid-19 sont vraiment conçus pour cibler la souche originale du virus et lutter davantage avec cette nouvelle variante. “Dans nos tests de culture cellulaire, nous avons constaté qu’Omicron a échappé massivement aux anticorps neutralisants, que ce soit de la vaccination ou des anticorps monoclonaux thérapeutiques, qui sont donnés aux patients à risque de maladie grave”, a déclaré Olivier Schwartz, responsable du virus et de l’immunité à l’Institut Pasteur. .
… Mais qui n’a pas provoqué de saturation hospitalière
La capacité d’Omicron à percer certaines des défenses du système immunitaire pourrait faire craindre une saturation élevée des hôpitaux, voire un carnage. Heureusement, ce scénario catastrophe ne s’est pas produit. “Le pourcentage de formes sévères observées après infection à Omicron est très faible, explique Olivier Schwartz, qui a donné la première explication. A cause du nez et de la gorge et probablement moins de poumons.”
Le contexte épidémique dans lequel l’option a émergé a également joué pleinement son rôle. “Omicron est apparu en France à une époque où la population était majoritairement vaccinée ou avait été exposée au virus dans le passé”, précise Sandrine Sarazin. Si les anticorps produits par le vaccin ne préviennent pas l’infection, ils restent très efficaces pour protéger les patients contre les formes sévères du Covid-19. “On peut en voir une illustration à Hong Kong”, a déclaré Mathieu Mahevas. La zone est soumise à une vague de pollution liée à l’Omicron qui touche la population sous-vaccinée, notamment les personnes âgées. Cela entraîne un grand nombre d’hospitalisations. “
FRANCE 2
Ainsi, la forte proportion de personnes vaccinées dans la population française a permis d’éviter un raz de marée dans un hôpital, mais rend “très difficile d’évaluer objectivement la sévérité inhérente à Omicron”, a expliqué Claude-Agnès Raynaud, directrice de recherche. à l’Institut Necker pour enfants malades. L’immunologiste tient à vous rappeler que le virus est loin d’être inoffensif.
“Nous saluons le faible fardeau, mais plus de 100 personnes meurent chaque jour en France à cause du virus !” Nous sommes épuisés alors que la mortalité reste très élevée.
Claude-Agnès Raynaud, immunologiste
à franceinfo
D’autant plus que plus Omicron se propage, plus il risque de devenir plus effrayant. “Les virus ne sont pas vivants : ils ont besoin de nos cellules pour se multiplier, explique Sandrin Sarazin. Lorsque nos cellules copient leurs génomes, des erreurs peuvent se produire et des virus peuvent muter.” C’est ainsi qu’est apparue la sous-variante BA.2 d’Omicron. Encore plus portable, il a rapidement pris le dessus sur son frère aîné : dans la semaine du 4 avril, il représentait 99 % des cas séquencés de Covid-19, selon la Santé publique en France.
Un impact à long terme encore incertain
La pollution en cascade associée à Omicron et BA.2 va-t-elle modifier la dynamique de l’épidémie de territoire ? Dur à dire. “Des cas de réinfection par le Covid-19 ont été documentés, mais ce sont des personnes qui sont déjà atteintes par d’autres variants comme l’Alpha ou le Delta et qui ont ensuite été infectées par BA.1 (la souche originale d’Omicron) ou BA.2 . Actuellement, seuls quelques cas d’infection issus de BA.1 puis de BA.2 ont été documentés au Danemark”, a précisé Olivier Schwartz.
Verrons-nous l’émergence de nouvelles options ou sous-options ? Combien de temps dure l’immunité qui empêche l’infection? Et celui qui évite les formes graves ? “Tout cela est encore difficile à dire, estime Mathieu Mahevas. D’autant qu’il existe de nombreuses situations hybrides : des personnes infectées puis vaccinées, des personnes vaccinées qui ont été infectées ou infectées sans vaccination…”
Les conséquences à long terme de l’infection par Omicron doivent également être clarifiées. “La plupart des données longues de Covid font référence à des personnes infectées lorsque les vaccins n’étaient pas disponibles, ou à des patients dont le système immunitaire n’a pas bien répondu à la vaccination. Espérons que ce phénomène soit rare chez les personnes qui ont bien répondu à la vaccination », explique Claude-Agnès Reynaud.
“Il y a des virus dont certaines personnes ne se débarrassent jamais, comme le papillomavirus, précise Sandrine Sarazin. Après infection, il peut rester caché pendant dix ou vingt ans avant de provoquer un cancer du col de l’utérus, par exemple. Une étude a identifié le rôle de Virus d’Epstein-Barr, qui cause la mononucléose, dans le développement de la sclérose en plaques.De tels scénarios sont-ils possibles avec Omicron ? Percer ces secrets nécessitera des recherches supplémentaires et du temps.
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